Giovanni Paolella
Laureato in Medicina e Chirurgia alla Federico II di Napoli nel 1980, ha prima lavorato come ricercatore a Napoli presso la Facolta' di Medicina e successivamente ha trascorso due periodi di studio all'estero presso il dipartimento di Patologia dell'Universita' di Oxford. Ha inoltre trascorso un lungo periodo di studio all'European Molecular Biology Laboratory di Heidelberg. G. Paolella e' professore ordinario di Biochimica dal 1994 dapprima presso l’Università del Molise e, a partire dal 2006, presso l'Universita' degli Studi di Napoli Federico II.
Dal 2011 al 2019 ha guidato il corso di Laurea in Biotecnologie per la Salute, prima come Presidente e poi come Coordinatore.
Presso il Ceinge ha coordinato, Rin dalla iniziale costituzione del centro di ricerca, e coordina tutt’oggi il gruppo di lavoro che svolge attività di ricerca nell’ambito di analisi computazionale di dati genomici, trascrittomici e provenienti da microscopia dinamica.
Analisi di dati genomici e modelling e simulazione di popolazioni cellulari in coltura.
La ricerca si basa sull’applicazione di strumenti e procedure computazionali a problemi biologici, tra cui l’identiRicazione di elementi funzionali genomici e l’analisi dinamica del comportamento di cellule eucariotiche normali e patologiche in coltura, in termini di pattern di migrazione e di tassi di proliferazione.
L'analisi computazionale dei dati sperimentali viene combinata con approcci molecolari e cellulari volti a identiRicare le caratteristiche dei processi biologici coinvolti e a descrivere numericamente e prevedere i processi in esame.
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Sviluppo di strumenti computazionali per gestire, analizzare e condividere grandi volumi di dati biologici
L'attività in questo campo è Rinalizzata a generare moduli e programmi che implementano algoritmi avanzati per l’analisi di grandi volumi di dati provenienti sia da indagini in campo genomico/trascrittomico che da elaborazioni numeriche di dati contenuti in immagini biologiche. -
Analisi computazionale e modelling del movimento e della proliferazione di cellule di mammifero osservate in coltura con microscopia time-lapse
Per lo studio della migrazione e proliferazione di cellule in coltura, la microscopia dinamica viene integrata con l'analisi dell'immagine e con la quantiRicazione numerica e l’analisi statistica associando agli studi sperimentali lo sviluppo di strumenti di analisi, speciRicamente prodotti a supporto delle indagini.
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Simulazione dei pattern migratori e della proliferazione di cellule in vitro e della regolazione mediante reti di interazione molecolare
Il lavoro in questo campo ha condotto alla realizzazione di un sistema di simulazione capace di predire il comportamento di popolazioni cellulari eucariotiche coltivate in vitro. Il sistema è stato sviluppato con un’enfasi speciRica sulla riproduzione di esperimenti di riparo delle ferite, ma lavora simulando cellule come singole entità e utilizzando modelli di processi cellulari quali la crescita, la proliferazione e la migrazione che lo rendono utile per la produzione di popolazioni sintetiche in diversi contesti sperimentali. Il sistema di simulazione si interfaccia con un tool di predizione di attivazione di pathway molecolari coinvolti nei processi di migrazione e proliferazione.
- Angelo Boccia, senior researcher
- Leandra Sepe, senior researcher
- Rossella Tufano, PhD student
- Rocco Caggiano, PhD student
- Elvira Toscano, PhD student
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The complete 12 Mb genome and transcriptome of Nonomuraea gerenzanensis with new insights into its duplicated "magic" RNA polymerase. D'Argenio V, Petrillo M, Pasanisi D, Pagliarulo C, Colicchio R, Talà A, de Biase MS, Zanfardino M, Scolamiero E, Pagliuca C, Gaballo A, Cicatiello AG, Cantiello P, Postiglione I, Naso B, Boccia A, Durante M, Cozzuto L, Salvatore P, Paolella G, Salvatore F, Alifano P. Sci Rep. 2016 Dec 21;6(1):18. doi: 10.1038/s41598-016-0025-0.
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Complete sequencing of Novosphingobium sp. PP1Y reveals a biotechnologically meaningful metabolic pattern. D'Argenio V, Notomista E, Petrillo M, Cantiello P, Cafaro V, Izzo V, Naso B, Cozzuto L, Durante L, Troncone L, Paolella G, Salvatore F, Di Donato A. BMC Genomics. 2014 May 19;15:384. doi: 10.1186/1471-2164-15-384.
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DNA sequence capture and next-generation sequencing for the molecular diagnosis of genetic cardiomyopathies. D'Argenio V, Frisso G, Precone V, Boccia A, Fienga A, Pacileo G, Limongelli G, Paolella G, Calabrò R, Salvatore F. J Mol Diagn. 2014 Jan; 16(1):32-44. doi: 10.1016/j.jmoldx.2013.07.008. Epub 2013 Oct 31.
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Ras activated ERK and PI3K pathways differentially affect directional movement of cultured Ribroblasts. Sepe L, Ferrari MC, Cantarella C, Fioretti F, Paolella G. Cell Physiol Biochem. 2013;31(1):123-42. doi: 10.1159/000343355. Epub 2013 Jan 29.
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Analysis and modelling of motility of cell populations with MotoCell. Cantarella C, Sepe L, Fioretti F, Ferrari MC, Paolella G. BMC Bioinformatics. 2009 Oct 15;10 Suppl 12:S12. doi: 10.1186/1471-2105-10-S12-S12.